Table 4 Molecular docking analysis of SM’s (1–4, 6) against S. aureus
Compounds | Docking Score | Rmsd | Distances | Residues |
|---|---|---|---|---|
DNA GYRASE SUBUNIT B (pdb id: 4uro) | ||||
 SM-1 | −6.79 | 0.61 | 4.08 | Ile A: 51 Ile A:86 Asn A:54 |
 SM-2 | −7.39 | 1.12 | 5.13 4.80 3.29 | Asn A:145 GLN D: 196 Asp A:89 |
 SM-3 | −6.87 | 1.25 | 4.09 | Ile A: 86 Asp A: 81 Asn A: 84 |
 SM-4 | −8.55 | 2.33 | 5.6 | Gln D: 196 Pro A: 87 Glu D: 193 |
 SM-6 | −9.57 | 2.13 | 3.72 4.08 3.85 4.96 | Asp A: 89 Arg A:144 Gln D: 197 Ile A: 90 |
Penicillin binding protein 2a (pdb id:1mwt) | ||||
 SM-1 | −8.56 | 1.73 | 4.24 4.18 5.80 7.08 | Glu A:150 Lys A:153 Asp A:320 Arg A:151 |
 SM-2 | −8.36 | 0.45 | 4.28 3.33 3.91 | Glu A:150 Lys A:153 Asp A:323 |
 SM-3 | −6.71 | 0.84 | 4.70 5.24 4.08 3.97 | Ile A:309 Glu B:145 His A:143 Asn B:146 |
 SM-4 | −9.43 | 1.73 | 2.74 5.15 4.37 3.58 5.44 4.67 | Lys A:317 Glu B:239 Leu A:147 Lys A:318 Glu A:315 Glu B:237 |
 SM-6 | −10.14 | 1.23 | 6.52 6.48 5.68 | Lys A:318 Lys A:153 Glu A:161 |